Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfwd2Q9R1A8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfwd2Q9R1A8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfwd2Q9R1A8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfwd2Q9R1A8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms