Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Plod1Q9R0E2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod1Q9R0E2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod1Q9R0E2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod1Q9R0E2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms