Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1bp2Q9R000 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itgb1bp2Q9R000 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb1bp2Q9R000 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms