Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo1Q9QZ11 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Exo1Q9QZ11 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Exo1Q9QZ11 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Exo1Q9QZ11 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms