Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc39a1Q9QZ03 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc39a1Q9QZ03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc39a1Q9QZ03 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc39a1Q9QZ03 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc39a1Q9QZ03 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms