Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYJ7

Dusp13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp13Q9QYJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dusp13Q9QYJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp13Q9QYJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp13Q9QYJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp13Q9QYJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms