Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh5Q9QUM7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msh5Q9QUM7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh5Q9QUM7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh5Q9QUM7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms