Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLY0

Socs6, Suppressor of cytokine signaling 6, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs6Q9JLY0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Socs6Q9JLY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Socs6Q9JLY0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Socs6Q9JLY0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Socs6Q9JLY0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Socs6Q9JLY0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Socs6Q9JLY0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms