Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr5Q9JLF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr5Q9JLF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr5Q9JLF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr5Q9JLF7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms