Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin3Q9JLB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nectin3Q9JLB9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nectin3Q9JLB9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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