Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnot9Q9JKY0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnot9Q9JKY0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot9Q9JKY0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms