Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upk3aQ9JKX8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk3aQ9JKX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Upk3aQ9JKX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms