Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ndufaf3Q9JKL4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ndufaf3Q9JKL4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms