Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx20Q9JJY4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddx20Q9JJY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddx20Q9JJY4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx20Q9JJY4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx20Q9JJY4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
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