Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ascl3Q9JJR7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ascl3Q9JJR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ascl3Q9JJR7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ascl3Q9JJR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms