Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2ird1Q9JI57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird1Q9JI57 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms