Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc40a1Q9JHI9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc40a1Q9JHI9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc40a1Q9JHI9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc40a1Q9JHI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc40a1Q9JHI9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc40a1Q9JHI9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms