Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf3Q9ET30 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tm9sf3Q9ET30 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm9sf3Q9ET30 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms