Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrnb2Q9ERK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrnb2Q9ERK7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms