Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lima1Q9ERG0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lima1Q9ERG0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lima1Q9ERG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lima1Q9ERG0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms