Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sertad3Q9ERC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sertad3Q9ERC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sertad3Q9ERC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sertad3Q9ERC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sertad3Q9ERC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sertad3Q9ERC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sertad3Q9ERC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sertad3Q9ERC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms