Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tor1bQ9ER41 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1bQ9ER41 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1bQ9ER41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms