Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlr9Q9EQU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr9Q9EQU3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms