Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS7

Vmn1r65, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r65Q9EPS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r65Q9EPS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r65Q9EPS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r65Q9EPS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r65Q9EPS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r65Q9EPS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r65Q9EPS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r65Q9EPS7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms