Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnft1Q9DCN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnft1Q9DCN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnft1Q9DCN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms