Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBI0

Tmprss6, Transmembrane protease serine 6, mousemouse

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss6Q9DBI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmprss6Q9DBI0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmprss6Q9DBI0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmprss6Q9DBI0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmprss6Q9DBI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms