Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SelenooQ9DBC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SelenooQ9DBC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SelenooQ9DBC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SelenooQ9DBC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms