Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc54Q9DAL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc54Q9DAL3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms