Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9DAE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9DAE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DAE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DAE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DAE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9DAE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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