Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift43Q9DA69 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift43Q9DA69 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift43Q9DA69 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift43Q9DA69 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift43Q9DA69 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift43Q9DA69 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift43Q9DA69 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms