Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmco5aQ9D9D5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmco5aQ9D9D5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms