Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snx5Q9D8U8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snx5Q9D8U8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snx5Q9D8U8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snx5Q9D8U8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms