Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf3c6Q9D8P7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms