Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc130Q9D516 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc130Q9D516 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc130Q9D516 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc130Q9D516 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 911.2 ms