Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms