Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx29Q9D3S3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx29Q9D3S3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx29Q9D3S3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms