Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Stx11Q9D3G5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx11Q9D3G5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stx11Q9D3G5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx11Q9D3G5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Stx11Q9D3G5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms