Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc6bQ9D289 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc6bQ9D289 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms