Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MceeQ9D1I5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MceeQ9D1I5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MceeQ9D1I5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms