Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpsap1Q9D0M1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpsap1Q9D0M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpsap1Q9D0M1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpsap1Q9D0M1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms