Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrs1Q9CYH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrs1Q9CYH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrs1Q9CYH6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rrs1Q9CYH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrs1Q9CYH6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrs1Q9CYH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rrs1Q9CYH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms