Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mis12Q9CY25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mis12Q9CY25 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mis12Q9CY25 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms