Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sgo1Q9CXH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sgo1Q9CXH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sgo1Q9CXH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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