Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sugt1Q9CX34 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sugt1Q9CX34 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sugt1Q9CX34 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sugt1Q9CX34 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms