Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cxxc1Q9CWW7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxxc1Q9CWW7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms