Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smyd3Q9CWR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smyd3Q9CWR2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smyd3Q9CWR2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms