Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx2Q9CWK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx2Q9CWK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx2Q9CWK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms