Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atxn3Q9CVD2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Atxn3Q9CVD2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atxn3Q9CVD2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atxn3Q9CVD2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atxn3Q9CVD2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atxn3Q9CVD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms