Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Sycp2Q9CUU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Sycp2Q9CUU3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Sycp2Q9CUU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Sycp2Q9CUU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Sycp2Q9CUU3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Sycp2Q9CUU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Sycp2Q9CUU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms