Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prps2Q9CS42 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prps2Q9CS42 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prps2Q9CS42 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prps2Q9CS42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prps2Q9CS42 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms